Technicien-ne en microbiologie H/F
Référence : 2024-1645648
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
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Employeur :
Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE)
INRAE Centre des Pays de la Loire - Localisation : 49 BEAUCOUZE
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) Non renseigné
- Catégorie Catégorie B (profession intermédiaire)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Vous aurez en charge :
- l'isolement de souches bactériennes présentes au sein du microbiote des plantes ;
- l'identification et le typage de ces souches par des méthodes moléculaires ;
- le phénotypage de ces souches en culture pure in vitro et en particulier le phénotypage métabolique ;
- l'étude des interactions entre micro-organismes dans des dispositifs de confrontation in vitro et in planta ;
- la participation aux travaux de construction de communautés synthétiques ;
- l'étude du pouvoir pathogène des communautés synthétiques construites ;
- la mise en forme des résultats et leur analyse ;
Vous serez accompagné-e dans ces missions par des spécialistes en analyse des communautés microbiennes et épidémiologie végétale.
Pour mener à bien ces missions, vos activités consisteront à :
- Planifier et réaliser des expériences en microbiologie (techniques usuelles de microbiologie et de biologie moléculaire) ;
- Formaliser et actualiser l'ensemble des protocoles techniques ;
- Préparer tout ou partie de l'appareillage ;
- Appliquer et faire appliquer les règles de sécurité ;
- Gérer les stocks et les commandes courantes ;
- Participer à la formation technique des stagiaires et doctorants ;
- Suivre l'évolution des techniques du domaine d'activité.
Vous quantifierez les tailles des populations bactériennes par isolement et qPCR.
Vous utiliserez des équipements technologiques comme des séquenceurs de paillasse (MinION et MiSeq), des appareils de phénotypage du métabolisme microbien (Omnilog), des automates de pipetage et de suivi de croissance à haut débit des micro-organismes (EpMotion et MilliDrop) ainsi que les dispositifs de phénotypage des interactions plante-microorganismes disponibles sur la plateforme Phenotic.
Vous interagirez également avec le CIRM-CFBP (Collection française des bactéries associées aux plantes, plateforme IBiSA hébergée dans l'équipe) pour la conservation des souches que vous isolerez et la conservation des metadata associées.
Profil recherché
Formation recommandée : Génie Biologique, microbiologie ou biologie des organismes et des populations.
Expérience souhaitée d'une année dans un laboratoire.
Au-delà des compétences techniques en microbiologie et biologie moléculaire les capacités personnelles suivantes sont recherchées :
- Sens de l'observation, curiosité, rigueur, précision ;
- Méthode et application dans le travail ;
- Goût pour l'apprentissage et le développement de techniques ;
- Communication orale et écrite des résultats/observations ;
- Goût pour le travail en équipe ;
- Maitrise de l'anglais (écrit et parlé) ;
- Maîtrise de l'environnement informatique de base (suite bureautique, R).
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 4 Baccalauréat
Éléments de candidature
Personnes à contacter
- Matthieu BARRET
- Marie-Agnès JACQUES
Qui sommes-nous ?
NOTRE AMBITION : AGIR POUR LA VIE, L’HUMAIN, LA TERRE
Premier organisme de recherche spécialisé au monde en agriculture, alimentation et environnement, INRAE est né le 1er janvier 2020 de de la fusion entre l’INRA et IRSTEA. Nous sommes une communauté de travail de 12 000 personnes, avec plus de 200 unités de recherche et une quarantaine d’unités expérimentales implantées dans 18 centres sur toute la France.
Notre Mission ?
Face à l’augmentation de la population, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE construit des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources.
Pour répondre à ces grands enjeux mondiaux, nous avons besoin de renfort dans nos équipes. Des métiers de la recherche aux métiers de l’appui, l’INRAE recrute à tout niveau de diplôme (du CAP/BEP à Bac+8) !
Rejoignez une communauté engagée et agissez pour l’intérêt général !
Descriptif du service
Vous travaillerez au sein de l'Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), dans l'équipe EmerSys, qui compte 21 personnels permanents d'INRAE, de l'Université d'Angers et de l'Institut Agro Rennes-Angers. Les travaux de notre équipe concernent à la fois l'émergence des phytobactérioses et le rôle du microbiote associé aux organes végétaux comme levier pour gérer les populations d'agents phytopathogènes. Notre objectif global est de limiter l'impact des bactéries phytopathogènes sur la productivité des plantes. Pour atteindre cet objectif, nous analysons les interactions entre les bactéries phytopathogènes, la plante hôte et son microbiote. L'étude de ces interactions nécessite des étapes d'isolement et de caractérisation de la diversité bactérienne associée aux plantes, puis la mise en place d'expérimentations de confrontation entre les 3 types de partenaires (plantes, agents phytopathogènes et membre du microbiote) pour être à même de mesurer comment peut être modulée l'agressivité des bactéries. Ces expérimentations doivent également permettre de mieux comprendre les mécanismes impliqués dans l'évolution de leur gamme d'hôte et de leur pouvoir pathogène.
À propos de l'offre
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Vous exercerez votre activité en milieu confiné (bactéries OGM et de quarantaine).
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Vacant à partir du 01/02/2025
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Technicienne / Technicien en expérimentation et production végétale
