Responsable de la Gestion et de l'Interopérabilité de Données d'Océanographie Biologique (Chief Data Ma
Référence : FR3761-SYLGES-032
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 06234 VILLEFRANCHE SUR MER (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
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Nature du contrat
CDD de 2 ans
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) Entre 2 349,06 € et 3046,44 € (fonction de l'expérience) € brut/an
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
La/Le Scientifique Responsable de la Gestion des Données (Chief Data Manager) d’AO-EMBRC assurera le suivi, la gestion et l'interopérabilité des données collectées dans le cadre du projet, qui sont de nature diverse (génomique, imagerie, taxinomie classique, physico-chimie, etc). Il/elle suivra leur récolte, leur traitement initial, leur interopérabilité avec les bases de données de référence, leur mise à disposition pour le public et leur intégration dans les processus d'analyse.
Activités :
Activités principales (les plus importantes sont 2 et 3)
1. Animer des ateliers d’expression des besoins internes puis rédiger la spécification des besoins en identifiant les solutions déjà existantes et en écrivant le cahier des charges de celles à développer
2. Mettre en œuvre des systèmes d'information et de traitement existants ou en concevoir de nouveaux permettant de collecter, structurer, stocker, qualifier et envoyer les données vers des systèmes d'information internationaux
3. Créer un système permettant de mettre en relation des données de nature différente, stockées dans des bases actuellement distinctes (génomique, imagerie, environnement)
4. Assurer une veille technologique concernant la gestion de grands volumes de données en suivant les principes F.A.I.R. et les directives institutionnelles
5. Administrer les machines locales sur lesquelles reposent une partie des systèmes d'information et de traitement de la donnée, en relation avec le service informatique dédié.
6. Former, en interne et en externe, aux principes et à la mise en œuvre des techniques de gestion des données biologiques
7. Participer à la diffusion et valorisation des résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, publications et présentations orales
8. Pour les nouvelles collectes de données, participer à la définition du plan de gestion des données le mieux adapté au problème posé
9. Contribuer à des réseaux professionnels d'échange de compétences
Contexte de travail :
Au sein de Sorbonne Université, le Centre National de Ressources Biologiques Marines (EMBRC-France) est une infrastructure de recherche (IR) nationale en biologie et écologie marines, lauréate du Programme Investissements d’Avenir (PIA) et portée par Sorbonne Université et le Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS). Elle implique les trois stations marines sous tutelle de Sorbonne Université et du CNRS, sur les sites de Roscoff (Station Biologique de Roscoff, SBR), Banyuls-sur-Mer (Observatoire Océanologique de Banyuls-sur-Mer, OOB), et Villefranche-sur-Mer (Institut de la Mer de Villefranche, IMEV). Cette infrastructure nationale constitue le nœud français de l’ERIC EMBRC, infrastructure européenne de recherche en biologie et écologie marines, dont le siège est situé à Sorbonne Université.
EMBRC-France a pour missions de soutenir la recherche sur les organismes et les écosystèmes marins, et de favoriser leur explo
Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...
Profil recherché
Competences :
Connaissances et Compétences opérationnelles :
● Maîtrise des outils et concepts lié à la gestion, l'interopérabilité et à la diffusion ouverte de données multimodales
● Maîtrise de la gestion de grands volumes de données sous forme de base SQL, no-SQL ou de collections de fichiers tabulaires (csv, parquet, etc.)
● Maîtrise des environnements Unix/Linux (administration système, shell, etc.)
● Connaissance d'un langage de programmation et de traitement de données (e.g. Python, R, Perl).
● Connaissance et capacité à mettre en œuvre une démarche qualité
● Idéalement, connaissance du stockage, traitement et analyse de données d'océanographie biologique (de génomique et/ou imagerie et/ou taxinomie et/ou physico/chimie)
● Langue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues)
Contraintes et risques :
? Interactions indispensables avec l’ensemble des interlocuteurs
? Déplacements réguliers sur les différents sites des partenaires du projet (Roscoff, Banyuls, Villefranche)
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 6 Licence/diplômes équivalents
- Spécialisation Informatique, traitement de l'information, réseau de transmission des données
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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EMPLOYEUR : SORBONNE UNIVERSITE (SU)
La grille de rémunération appliquée sera celle de l'employeur SU
Diplôme réglementaire exigé : Diplôme d'ingénieur, Master 2, éventuellement Doctorat
Domaine(s) de formation souhaités : Data management, bio-informatique, administration système
Contacts :
• Eric Pelletier eric.pelletier@genoscope.fr
• Erwan Corre corre@sb-roscoff.fr
• Lionel Guidi lionel.guidi@imev-mer.fr -
Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Urbaniste des systèmes d'information