Post-doctorant (H/F)

Référence : UMR8120-SANLEB-006

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 91190 GIF SUR YVETTE (France)
Domaine : Recherche
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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat Non renseigné
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) entre 3081,33 € et 4291,70 bruts € brut/an
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Missions :
Le post-doctorant recruté aura pour mission de :
• Réaliser des études d’association pangénomique (GWAS) sur plusieurs caractères d’intérêt liés au développement du haricot dans différents environnements et évaluer l’impact des interactions GxE sur l’expression des caractères cibles. Une méta-analyse GWA sera réalisée pour identifier les locus impliqués dans les interactions GxE [2].
• Identifier des régions génomiques associées à des facteurs environnementaux spécifiques (ex. température, disponibilité en eau, fertilité des sols) et évaluer leur contribution à la variation phénotypique afin de mieux comprendre l’adaptation locale des variétés.
• Explorer le chevauchement potentiel entre les locus d’interactions GxE et les locus d’association environnementale, afin d’identifier les polymorphismes génétiques impliqués dans la réponse à des signaux environnementaux spécifiques.
• Développer des modèles de prédiction génomique pour plusieurs caractères d’intérêt liés au développement et à la croissance du haricot, et analyser le gain potentiel d’inclure les locus identifiés par GWA dans ces modèles [3].
• Utiliser la sélection génomique (GS) pour prédire les performances du panel R-core et identifier parmi ce panel des sources originales de diversité [4].
Activités :
Analyse des mécanismes génétiques de l'adaptation environnementale chez le haricot commun
Contexte de travail :
Dans le contexte des changements climatiques, un enjeu majeur en amélioration des cultures est de développer des variétés adaptées aux contraintes environnementales pour garantir la sécurité alimentaire humaine. Les informations moléculaires désormais disponibles pour de nombreuses espèces permettent d’identifier les loci impliqués dans la variation de caractères complexes grâce aux études d’association pangénomique (GWAS) et d’améliorer l’efficacité des schémas de sélection via des modèles de prédiction en sélection génomique (GS). Une fois calibrés sur des individus à la fois phénotypés et génotypés, les modèles GS permettent de prédire les performances des plantes dans des environnements où elles n’ont pas encore été observées, et d’identifier des sources originales de diversité. L’application des GWAS et de la GS aux cultures comme le haricot commun (Phaseolus vulgaris) devrait permettre d’améliorer les stratégies de sélection et d’augmenter la productivité des cultures.
Le projet INCREASE [1] combine des approches de pointe en génétique et génomique des plantes, un phénotypage à haut débit, y compris le phénotypage moléculaire (transcriptomique et métabolomique, par exemple), afin de renforcer la conservation des ressources génétiques des légumineuses alimentaires européennes, notamment le haricot commun, et d’en promouvoir l’utilisation et la valorisation.
Dans ce projet, des données phénotypiques sur plus de 450 lignées séquencées de haricot commun ont été collectées dans six environnements bien caractéri
Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...

Profil recherché

Competences :
Le candidat devra posséder un doctorat en génétique quantitative (incluant une expérience en GWA), statistiques/biostatistiques ou biologie computationnelle appliquée à la génétique quantitative. Une solide expérience en programmation sous R, en gestion de grands jeux de données, en visualisation des données, ainsi qu’une bonne maîtrise des outils de versioning sont requises. Une connaissance préalable du haricot commun et/ou des variables climatiques serait un atout.
Contraintes et risques :
NC

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
  • Spécialisation Formations générales

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

En savoir plus sur l'employeur

À propos de l'offre

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant

  • Chercheuse / Chercheur

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