Post-doctorant (H/F)

Missions :
Le post-doctorant recruté aura pour mission de :
• De tester la co-introduction de ces deux espèces en s’appuyant sur les données génomiques du projet et celles disponibles pour des maïs et haricots européens et américains (populations sources) et de mettre en œuvre des approches de génomique du paysage en Europe (géographie de la diversité génétique).
• De combiner les entretiens avec des agriculteurs, des données génomiques et phénotypiques obtenues sur des variétés locales de maïs et de haricot de Transylvanie pour étudier la structuration diversité génétique des variétés de ferme (in situ). L’une des questions ici sera de s’interroger sur la façon dont les trois communautés humaines présentes en Transylvanie structurent cette diversité.
• De réaliser des analyses de scan génomiques sur ces variétés locales de maïs et haricot afin d’identifier des locus ciblés par la sélection, et de détecter potentiellement des sélections différentielles entre communautés liés à des différences d’usage et de préférence. Ces analyses devront être réalisées séparément pour les fractions du génome issues des pools andins et mésoaméricains.
Activités :
Analyse de données génomiques des haricots et des maïs co-cultivés en Europe et étude de leur structuration génomique dans le cadre du projet INCREASE.
Contexte de travail :
Les associations de cultures présentent de nombreux avantages aux monocultures. Ces avantages reposent sur les synergies entre espèces cultivées, qui résultent de la complémentarité entre espèces, du partage des ressources et des processus de facilitation. Parmi les bénéfices, on peut citer une plus grande robustesse face aux perturbations climatiques et biotiques, une meilleure optimisation de l’utilisation des ressources, ainsi qu’une compétitivité accrue réduisant le besoin en herbicides.
Dans le cadre du projet européen INCREASE [1], nous nous intéressons à l’association maïs-haricot. Le maïs est une plante allogame domestiquée il y a environ 9 000 ans au Mexique. La diffusion des variétés traditionnelles de maïs sur le continent américain a suivi deux grandes expansions, vers le nord et vers le sud depuis le Mexique. De manière similaire, deux introductions indépendantes ont été décrites en Europe : l’une depuis les États-Unis vers l’Europe du Nord, et l’autre depuis les Caraïbes ou l’Amérique du Nord/Sud vers le sud de l’Espagne [2]. La culture des variétés paysannes de maïs est encore largement répandue au Mexique, et une étude a mis en évidence comment la structure ethnolinguistique influence leur différenciation génétique et morphologique [3]. Le haricot commun est une plante autogame dont la forme sauvage est également originaire du Mexique. Cependant, des migrations et des adaptations ultérieures en Amérique du Sud ont conduit à l’émergence de deux principaux pools génétiques géographiquement distincts et partiellement isolés : le pool mésoaméricain et le pool andin.
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