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Post-doctorant (H/F) en physique appliquée à la modélisation multi-échelle de la dynamique des tissus b

Référence : UMR3738-LAUBAL0-005

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 75724 PARIS 15 (France)
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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat Non renseigné
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) entre 3081 € et 4756 € bruts mensuels selon expérience € brut/an
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Missions :
Nous recherchons un physicien pour un contrat postdoctoral de deux à trois ans dans le cadre du projet ERC SyG PEPS. Le projet a pour but de modéliser, par des méthodes biophysiques, la dynamique spatio-temporelle d’interactions et de changements d’état cellulaires qui sous-tend l’homéostasie dynamique de la population de cellules souches neurales du cerveau antérieur.
Activités :
- rôle principal : développer une modélisation du système de cellules souches basée sur les interactions cellulaires médiées par la voie de signalisation Notch en utilisant une représentation spatiale en « lattice » et une progression de lignage simple inférée par des critères morphométriques et fonctionnels (modélisation à base d’agents et d’équations différentielles)
- rôle principal : complexifier progressivement les états cellulaires dans cette modélisation en y intégrant des données continues de trajectoire cellulaire révélées par transcriptomique (équations différentielles partielles et structure compartimentée)
- rôle principal : travailler à l’interface avec les biologistes pour confronter les modèles au résultat de perturbation biologiques induites, et pour inférer, à l’aide des modèles, de nouvelles interactions cellulaires ou de nouveaux paramètres de changements d’état cellulaire qui peuvent être ensuite testés expérimentalement.

Contexte de travail :
Le laboratoire se trouve à l’institut Pasteur dans l’UMR3738 (biologie du développement et cellules souches). Il est actuellement composé de 14 personnes (3 postdocs, 2 étudiant(e)s en thèse, 3 chercheurs/es CNRS, 5 ingénieur(e)s, 1 technicien animalier).
Le laboratoire étudie les cellules souches neurales avec pour modèle le cerveau du poisson zébré. Nous cherchons à comprendre comment sont régulés et coordonnés les choix cellulaires de division et différenciation.

Profil recherché

Competences :
- doctorat en physique appliqué à la biologie, notamment aux modélisations de comportements multicellulaires
- expérience préalable en modélisation biophysique des interactions cellulaires, idéalement de la voie de signalisation Notch et idéalement dans le modèle poisson zébré, sous forme d’équations différentielles
- souhaitable : expérience dans l’analyse de sensibilité des paramètres et la théorie de l’information
- coder en R, Python ou Matlab
- connaissances théoriques en biologie du développement et/ou biologie des cellules souches (notions d’état cellulaire, de destin, de lignage, de signalisation)

Contraintes et risques :

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
  • Spécialisation Formations générales

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

En savoir plus sur l'employeur

À propos de l'offre

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant
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