Ingénieur(e) bioinformatique H/F
Référence : UMR7275-GEOVAS-010
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 06560 VALBONNE (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) Entre 2875 et 3550 € brut mensuels selon expérience € brut/an
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
Analyse bioinformatique de données transcriptomique (bulk et single-cell RNAseq) dans le cadre de projets étudiant la réponse de l'épithélium des voies respiratoires à des agents cancérigènes. Analyses « long-reads » sont également, envisagées.
Mise en œuvre et amélioration de pipelines d'analyse déjà existants dans l'équipe. Si nécessaire, développement de nouveaux pipelines.
Veille technologique afin d'évaluer de nouveaux pipelines.
Exploration et exploitation des données dans le but d’écrire des articles scientifiques.
Gestion des interactions avec les partenaires du projet (biologie des systèmes, intelligence artificielle).
Activités :
Choisir et adapter les pipelines d'analyse transcriptomiques sur cellule unique et en « bulk RNAseq » aux questions biologiques posées par l'équipe de recherche
Analyser les résultats provenant des chercheurs de l'équipe et les replacer dans le contexte des résultats obtenus par d'autres équipes
Gérer les projets conjointement avec les chercheurs et doctorants de l'équipe.
Rédiger des rapports d'expérience.
Participer à la veille scientifique et technologique sur les analyses de données transcriptomique.
Contexte de travail :
Le poste est à pourvoir au sein de l'Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire à Valbonne – Sophia Antipolis (Alpes Maritimes). L'IPMC regroupe 22 équipes de recherche et des services communs pour un effectif global de plus de 255 personnes. La personne recrutée travaillera au sein de l'équipe de recherche « Génome non-codant et pathologies pulmonaires » et dans la cadre du hub de bioinformatique CoBioDa. Elle travaille de manière étroite avec la plateforme de génomique de l'IPMC, UCAGenomiX.
Profil recherché
Competences :
• Connaissances en analyse transcriptomique
• Biologie (connaissance approfondie)
• Notions opérationnelles d'anglais
• Mettre en œuvre des pipelines d'analyse transcriptomique sous R
• La maitrise de Python est un plus
• Aptitude à la communication orale et écrite (français/anglais)
• Capacité à travailler en étroite collaboration avec les différents collaborateurs du projet.
Contraintes et risques :
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques
