Ingénieur en développement d'outils informatiques pour la microscopie SMLM H/F

Référence : UMR5297-MELDES0-248

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 33076 BORDEAUX (France)
Domaine : Recherche
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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat Non renseigné
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) Entre 2847.42 et 3005.46€ brut selon expérience € brut/an
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Missions :
Développer un ensemble de logiciels pour l'analyse et la reconstruction 3D des données de microscopie par localisation de molécules uniques (SMLM).
Activités :
Développer un ensemble d’outils informatiques dédiés à l’analyse et la reconstruction de données de microscopie SMLM dans le logiciel Napari (https://napari.org). Porter les codes existants du laboratoire (ondelettes, fit Gaussien, tracking développés en C/C++), et implémenter de nouvelles approches développées au sein d’autres laboratoires (spline, UI-PSF, etc.), en CPU et GPU. Effectuer une évaluation systématique des performances de chaque algorithme. Réaliser de la veille bibliographique et s’intéresser aux solutions d’acquisition permettant dans une seconde étape de réaliser de l’analyse SMLM en temps réel. Travail en autonomie sur projet principal et en équipe sur projets collaboratifs.
Contexte de travail :
Créé en 2011, l'IINS rassemble 180 scientifiques de différentes nationalités et de différents horizons (chimie, biologie structurale, biologie moléculaire et cellulaire, biophysique, médecine clinique, imagerie avancée, neurobiologie) pour comprendre le fonctionnement du cerveau dans les états sains et pathologiques. L'IINS mène des recherches multidisciplinaires à la pointe de la biologie des synapses et de la physiologie des systèmes neuronaux, en mettant l'accent sur le développement de nouvelles technologies et de nouveaux outils.

Profil recherché

Competences :
Les candidats doivent avoir de solides connaissances en programmation (C#/C++,.NET, Python) et être autonomes. Une connaissance des principes fondamentaux de la microscopie et des méthodes de super-résolution par localisation de molécules uniques est recommandée. Le candidat doit être motivé pour être formé, si nécessaire, à l'acquisition des données. D'excellentes aptitudes à la communication, une ouverture d'esprit et une capacité à collaborer dans un environnement interdisciplinaire sont requises.
Contraintes et risques :
Possibilité de travail en horaires décalés

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
  • Spécialisation Spécialités pluriscientifiques

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

En savoir plus sur l'employeur

À propos de l'offre

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant

  • Experte / Expert en instrumentation et expérimentation

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