Ingénieur-e développement en microscopie d'expansion (H/F)
Référence : UAR3420-MONFER-002
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 33077 BORDEAUX (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) entre 2847€ et 3005€ bruts mensuels selon expérience € brut/an
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
L'ingénieur-e devra prendre en charge de l'implémentation, l'optimisation et le développement des techniques de microscopie d'expansion en collaboration avec des équipes de recherche en neuroscience.
Activités :
Les activités du/de la candidat-e s’inscrivent principalement dans le cadre d’un projet collaboratif ANR, et se résument à :
- Mise en place des protocoles de préparation des échantillons pour la microscopie d’expansion en tissu. Ces protocoles devront s’appliquer sur des tranches organotypiques de cerveaux de souris.
- Optimisation et développement des marquages avec des sondes fluorescentes spécifiques pour des protéines de membrane (protéines d’adhésion et récepteurs membranaires).
- Le traitement et l’analyse d’image (FIJI et Jupyter notebooks), reconstruction 3D des images de microscopie d’expansion avec le logiciel Imaris. Développer une méthode de segmentation des composants biologiques.
- Prise en charge de l’activité expansion au BIC :
o Formation les utilisateurs à toutes les étapes de la préparation d’échantillons, de l’acquisition des images et de leur analyse
o Organisation de séminaires et d’évènements permettant de déployer la technique
o Mise en place et participation à des collaborations scientifiques.
- Rédaction de protocoles et d’articles de recherche méthodologiques.
Contexte de travail :
Le Bordeaux Imaging Center (BIC, UMS 3420) est la plus grande plateforme de microscopie d'Aquitaine. Le Pôle photonique du BIC fournit des prestations et des formations sur plus de 20 microscopes optiques à une large communauté de chercheurs du domaine biomédical public et privé.
L'activité de développement de microscopie photonique du BIC se consacre à l'implémentation et à la conception de techniques d'imagerie de pointe qui ne sont pas disponibles dans la communauté scientifique locale, donnant ainsi accès aux technologies les plus avancées. Dans ce cadre, la préparation d'échantillons biologiques pour l'imagerie photonique devient une des spécialités de notre plateforme.
Leurs échantillons biologiques sont observés à des échelles allant du centimètre, pour l'imagerie d'organes entiers, au nanomètre, pour le suivi de molécules uniques.
Le-la candidat-e sera sous la responsabilité directe d'une ingénieure de recherche CNRS en charge du développement méthodologique sur le pôle de microscopie photonique du BIC.
Lingénieur-e travaillera en proche collaboration avec les huit autres ingénieurs du pôle photonique, afin de s'intégrer dans l'organisation et le fonctionnement de la plateforme.
En effet, au-delà de l'activité de développement de la technique de microscopie d'expansion, le ou la candidat-e pourra participer à l'activité de service, en participant aux formations institutionnelles et aux formations individuelles des utilisateurs pour leurs accès à la plateforme.
Profil recherché
Competences :
- Maîtrise en biochimie de la protéine et des connaissances basiques en neurobiologie
- Solides connaissances en microscopie de fluorescence
- Expertise en traitement et analyse d'image et reconstruction 3D
- Participation à des projets de recherche
- Solides compétences en matière d'organisation et de communication
- Rigueur, motivation et capacité d'interaction avec les collègues et les collaborateurs
- Curiosité intellectuelle, goût pour la technologie et l'innovation
- Anglais niveau C1-C2
Contraintes et risques :
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques
