Ingénieur données de simulations de dynamique moléculaire (H/F)
Référence : UPR9080-PIEPOU-001
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 75005 PARIS 05 (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels environ 2800 € brut mensuel € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
- Concevoir un catalogue de données des simulations de dynamique moléculaire.
- Implémenter des outils pour la gestion et l’accès aux données de ce catalogue.
- Contribuer à l’enrichissement et à la normalisation des métadonnées du catalogue.
- Assurer l’intégration de ce catalogue dans l’écosystème du projet européen LUMEN, qui a pour objectif l’exploration et la découverte des produits de la recherche.
Activités :
- Collecter, centraliser et standardiser les métadonnées associées aux simulations de dynamiques moléculaires depuis des entrepôts de données généralistes (Zenodo, Figshare), des bases de donnéesspécialisées (NOMAD, ATLAS, GPRCRmd…) et la littérature scientifique.
- Concevoir un catalogue de données interrogeable par interface web et API
- Veiller à interopérabilité de ce catalogue de données avec la plateforme d’exploration des produits de la recherche développée dans le cadre du projet européen LUMEN.
- Enrichir les métadonnées par des techniques de fouille de données et d’intelligence artificielle (classification, Named Entity Recognition)
Contexte de travail :
Cette offre d’emploi d’inscrit dans le cadre du projet LUMEN, financé par l’Union européenne, visant à transformer la manière dont la recherche est produite, partagée et utilisée. Le domaine scientifique concerné ici est la dynamique moléculaire, en lien avec d'autres disciplines (mathématiques, SHS, sciences du système Terre). Le travail se fera au sein d’un consortium international, avec de nombreuses interactions avec des chercheurs et spécialistes de la donnée dans un cadre pluridisciplinaire.
Profil recherché
Competences :
Techniques
- Connaissance des méthodes, logiciels et protocoles en dynamique moléculaire.
- Expérience en traitement de données et de texte (machine learning, NLP) et des bibliothèques Python associé (scikit-learn, NLTK, spaCy)
- Maîtrise du développement logiciel en Python (bonnes pratiques, gestion de version, documentation, tests)
- Expérience en bas de données relationnelles (SQLite)
- Connaissances en API et web scraping.
- Usage d’artefacts sémantiques (ontologies, taxonomies).
- Connaissance des standards du web sémantique
Interpersonnelles et communication
- Bonne communication pour la collaboration interdisciplinaire.
- Capacité à vulgariser des concepts complexes.
- Esprit d’équipe, adaptabilité.
- Maîtrise de l’anglais.
Comportementales
- Curiosité scientifique, appétence pour les nouvelles technologies.
- Rigueur, sens de l’organisation, autonomie.
- Capacité à gérer plusieurs priorités.
Contraintes et risques :
- Nécessité d’une maîtrise des outils techniques pointus, en particulier dans l’automatisation et la gestion des métadonnées.
- Capacité à s’adapter à des données hétérogènes, à des standards en évolution, et à des contraintes d’intégration dans un écosystème large.
- Responsabilité dans la qualité et la cohérence des données exposées à la communauté scientifique.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques
