Ingénieur d'études en Génomique comparative des macroalgues brunes (H/F)
Référence : UMR8227-JERCOC-012
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 29688 (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) entre 2 466,98€ et 3 676,14€ selon expérience € brut/an
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
Les algues brunes restent encore mal caractérisées à l’échelle génomique par rapport à d'autres groupes eucaryotes majeurs tels que les plantes terrestres et les animaux. Pour en savoir plus sur la biologie de ce groupe d’organismes, la Station Biologique de Roscoff, en collaboration avec Genoscope et un consortium international, a réalisé un projet visant à générer des séquences génomiques complètes pour 40 espèces d’algues brunes et quatre groupes frères (https://phaeoexplorer.sb-roscoff.fr/home/). Les génomes sont désormais assemblés et annotés et les premiers réseaux métaboliques à l’échelle des génomes sont en cours d’élaboration.
La-le candidat(e) sera impliqué(e) dans l'analyse des séquences génomiques, en utilisant des approches de génomique comparative pour caractériser les familles de gènes (notamment associées aux caractéristiques biologiques clés des algues brunes), reconstruire des arbres des espèces à l’échelles des génomes et caractériser les mécanismes d’évolution à l’échelle des réseau métaboliques.
Activités :
- Traiter les analyses phylogénétiques et évolutives de familles de gènes
- Reconstruire des arbres phylogénétiques.
- Utiliser des approches de génomique comparative.
- Analyser des réseaux métaboliques
- Interpréter et mettre en forme (publication) des résultats obtenus
Contexte de travail :
La Station Biologique de Roscoff (SBR), dont l'UMR8227 fait partie, est un centre de recherche en biologie marine et océanologie (http://www.sb-roscoff.fr/about-roscoff-marine-station/missions.html). Elle est située dans la ville de Roscoff sur la côte nord de la Bretagne, à environ 60 km à l'est de Brest. La SBR comprend environ 200 personnels permanents.
ABiMS (http://abims.sb-roscoff.fr/) est une plateforme de bioinformatique travaillant en étroite collaboration avec plusieurs groupes de recherche au sein de la SBR. Elle fournit à la fois son expertise en analyse de données et développements, des outils et une infrastructure informatique performante permettant d'assurer contexte efficace pour une recherche intégrée. La personne recrutée travaillera au sein de la plateforme ABiMS .
Le poste inclura des interactions fortes avec l'équipe Dynamique et Organisation des Génomes de l'ENS Paris (pour la partie génomique comparative) et l'équipe Dyliss de IRISA à Rennes (pour la partie réseaux métaboliques) qui pourraient impliquer des déplacements.
Profil recherché
Competences :
Savoir faire:
- Traiter des données
- Interagir avec des biologistes et des informaticiens
- Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats
- Avoir des qualités rédactionnelles
- Transmettre des connaissances
- Utiliser les techniques de présentation
- Avoir des connaissances générales de l'annotation du génome eucaryotes et phylogénie moléculaire, en génétique et biologie moléculaire, en analyse statistique et de programmation
Savoir être:
- Sens relationnel
- Sens de l'organisation
- Etre rigoureux,créatif et autonome
Contraintes et risques :
Pas de contrainte ni de risque spécifique
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 6 Licence/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Experte / Expert en biologie - SVT