H/F Postdoctorat en apprentissage multimodales de données biologiques

Missions :
La mission de ce postdoctorat consiste à développer des solutions pour l’intégration de multiples modalités biologiques et à établir un lien entre le phénotype observé au microscope et les différentes mesures moléculaires de la cellule. Les méthodes seront validées sur des données de criblage à haut débit, incluant des images microscopiques ainsi que des données d’expression génétique et protéomique. Ce principe sera ensuite appliqué à l’élucidation de fonctions géniques encore inconnues.
Activités :
L’activité est principalement informatique. Elle concernera le développement de structure de modèles de réseaux de neurones profonds et leur entrainement. Elle consistera à étendre les résultats préliminaires que nous avons déjà obtenus dans le cadre de l’intégration de données d’imagerie microscopique avec des données transcriptomiques, grâce à la mise au point de variants de modèles de fusion de modalités.
Contexte de travail :
Le postdoctorat se déroulera à mi-temps au sein de l’équipe de bioimagerie computationnelle et bio-informatique à l’IBENS, sous la direction d’Auguste Genovesio. Le/La postdoctorant.e aura accès à un poste de travail, ainsi qu’un accès à des serveurs de calculs équipés de GPUs.