(H/F) Post-doctorant / Post-doctorante : en analyse de données de transcriptomique à haut débit
Référence : UMR5558-NATARB-085
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 69622 VILLEURBANNE (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) à partir de 3021 € brut mensuel selon expérience € brut/an
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
Ce recrutement s’inscrit dans le contexte du projet ANR Longevity, qui vise à comprendre les mécanismes moléculaires sous-jacents aux différences de longévité entre mâles et femelles dans différentes espèces. Le projet consiste, entre autres, à tester l’hypothèse du chromosome Y toxique, hypothèse qui sera évaluée chez la drosophile.
Le/la postdoctorant(e) travaillera dans le domaine de la génomique et de la biologie évolutive en analysant des données de transcriptomique à haut débit obtenues au cours de ce projet.
Activités :
• Développement de pipelines bioinformatiques pour l’analyse de données RNAseq et small RNA.
• Analyse différentielle de l’expression.
• Mise en place de mesures phénotypiques de longévité.
• Participation à des réunions scientifiques, tant nationales qu’internationales, ainsi qu’aux activités internes de l’équipe et du laboratoire.
Contexte de travail :
Le post-doctorat se déroulera au Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive (LBBE) (CNRS, Université Claude Bernard – Lyon 1, VetAgro Sup), au sein de l’équipe Génétique et Évolution des Interactions (GEI). Le LBBE regroupe une centaine de membres permanents, intéressés par des thématiques variées dans le domaine de l’évolution, de l’écologie et de la santé. Les grands axes de recherche de l’équipe GEI incluent l’évolution des interactions, la dynamique des génomes ainsi que les interactions entre éléments transposables et génome hôte.
La personne recrutée sera encadrée par Cristina Vieira du LBBE, au sein de l’équipe GEI.
Profil recherché
Competences :
Bioinformatique : Utilisation des outils en ligne de commande pour la mise au point de pipelines bioinformatiques robustes et reproductibles. Cela concerne principalement les analyses de RNAseq et small RNA. Une bonne connaissance de Gene Ontology est également requise.
Biologie fonctionnelle : Le projet mobilise des concepts de biologie évolutive et de biologie moléculaire évolutive. Une expérience dans la réalisation d’expériences de biologie moléculaire est nécessaire (PCRq, RT-qPCR, extraction d’ADN, extraction d’ARN).
Statistique et modélisation : Le projet nécessite une maîtrise des outils statistiques nécessaires à l’analyse différentielle d’expression, tels que les packages DeSeq2 ou EdgeR.
Rédaction et synthèse : Le projet est potentiellement vaste et nécessitera de grandes capacités de synthèse et de rédaction, ainsi qu’une grande autonomie, tant dans la réflexion que dans la mise en œuvre des analyses.
Contraintes et risques :
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
- Spécialisation Formations générales
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Nos petits + :
• Un environnement de travail stimulant au contact de personnels de la recherche
• Un accompagnement professionnel avec des formations internes au laboratoire
• Une possibilité de télétravailler
• Un restaurant d'entreprise qui permet de déjeuner à un prix intéressant.
• Le remboursement partiel des titres de transport (75%)
+ forfait mobilité durable pouvant aller jusqu'à 300€/an
• Un site accessible en transport en commun (Tram T1 + T4 + bus)
• 44 jours de congés / RTT par an
• Participation financière au frais de mutuelle -
Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Chercheuse / Chercheur
