chercheur H/F traitement d'images, classifications d'images pour l'aide au diagnostique d'échantillons
Référence : UMR7249-JULWOJ-001
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 13397 MARSEILLE 13 (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) 3081 et 4291 euros brut/mois selon expérience € brut/an
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
Il a été montré [1] que les motifs et la couleur de gouttelettes de sang séchées sont caractéristiques d’un certain nombre de paramètres physiologiques et chimiques du sang. Par exemple le taux de cholestérol (HDL ou LDL) fait fortement varier les motifs de craquelures de gouttelettes de sang séchées.
Le recrutement s'inscrit dans le projet ANR BloodDrop, en collaboration avec l’Institut Fresnel (Marseille), le C2VN (Marseille) et l’IUSTI (Marseille). Un des objectifs de ce projet est d’étudier plus en détails ces motifs de séchage et d’établir des prédictions de divers paramètres physiologiques et chimiques du sang à partir de la lecture d’images de gouttelettes séchées. Les principaux paramètres étudiés seront : le taux de cholestérol (HDL, LDL), l’anémie et le paludisme. Une base de données d’échantillons de sang est en cours de constitution au C2VN : des mesures précises des paramètres physiologiques et chimiques sont enregistrés en complément de l’image de la gouttelette séchée (dans des conditions de température et d’éclairement contrôlés).
[1] Brutin D. et al., Pattern formation in drying drops of blood, J. Fluid Mech., (2011)
Activités :
Des développements en traitement d’images (analyse de textures, reconnaissance des formes...) et en apprentissage (classification supervisée, SVM, random forest, neural networks...) devront être effectués pour mettre en correspondance les motifs de goutte de sangs séchées, et les paramètres physiologiques ou chimiques du sang. Des résultats préliminaires analysant les fréquences de répétitions des craquelures observables dans les images de gouttelettes de sang séchées ont montré une bonne capacité à prédire les mesures de HDL et LDL. Ces résultats devront être consolidés et améliorés au cours du contrat postdoctoral. D’autre méthodes devront être étudiées pour la prédictions d’autres paramètres (paludisme ou anémie), une analyse fine de la couleur et de sa calibration se révéleront probablement pertinentes.
Contexte de travail :
Le post-doctorat se déroulera au sein de l’Institut Fresnel à Marseille et sera encadré par Mouloud Adel (professeur des universités) et Julien Wojak (Ingénieur de recherche), une collaboration étroite avec les partenaires du projet, C2VN et IUSTI, sera nécessaire pour valider les développements effectués.
Profil recherché
Competences :
- traitement d'images,
- apprentissage machine,
- bonne maîtrise de python et des bibliothèques d'apprentissage machine,
- bonnes capacités relationnelles et de communication
Contraintes et risques :
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
- Spécialisation Formations générales
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Chercheuse / Chercheur